Озеро окружено горами Тескей Ала-Тоо на юге и Кунгей Ала-Тоо на севере. По форме озеро напоминает трапецию, обращенную основанием на север. Длина озера равна 178 км, ширина - 60 км, площадь - 6236 км2, длина береговой линии - 688 км, максимальная глубина - 669 м, средняя глубина - 278 м. Озеро невероятно красивое, именно поэтому его называют "Жемчужиной Кыргызстана". Цвет воды в озере Иссык-Куль меняется от нежно-голубых до темно-синих тонов.

Киргизия является одним из самых больших регионов, в котором находится система современных горных ледников, их общая площадь занимает 8100 км[sup]2[/sup] или 4,2% территории страны. Киргизская Республика имеет огромный запас водных ресурсов. В 7 самых больших речных бассейнах располагается более 28000 рек и истоков, 90% которых имеют длину 10 км. Среди крупных рек надо отметить реку Нарын протяжённостью более 500 км.