Территория Киргизии простирается с запада на восток на 900 км, с севера на юг на 410 км и лежит примерно между 39o и 43o северной широты. На территории страны расположены 2 крупные горные системы: Тянь-Шань и Памиро-Алай. Они разделены между собой Ферганской долиной, обладающей уникальной природной и исторической ценностью. Однако к Киргизии относится лишь небольшая её часть. Ош, второй по величине город в Киргизии, расположен на юго-восточной окраине Ферганской впадины у северного подножия Кичиалайского хребта. Столица Киргизии - город Бишкек находится в центральной части Чуйской долины у северного подножия Киргизского хребта (Тянь-Шань) на высоте 750 - 900 м.

Наиболее высоко поднятая часть территории страны находится на ее восточной окраине. Здесь, в горном узле, пограничном с Китаем, находятся высочайшие точки всей Тянь-Шаньской горной системы - пик Победы (7439 м) и Хан-Тенгри (6995 м). Отсюда хребты веерообразно расходятся на запад и юго-запад, создавая обособленные параллельные цепи, простирающиеся, в основном, в широтном направлении до 300 - 400 км. На крайней южной границе республики с Таджикистаном выделяется высочайший Чон-Алайский (Заалайский) хребет, где находится вторая по высоте вершина Киргизии - пик Ленина (7134 м).

В Киргизии четко выражена вертикальная климатическая поясность, она влияет как на климат, так и на растительный и животный мир, который очень разнообразен.